Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC01545Q5VT33 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms