Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GKAP1Q5VSY0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms