Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC29■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC29■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
FRMPD1Q5SYB0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FRMPD1Q5SYB0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms