Protein–RNA interactions for Protein: Q58FF7

HSP90AB3P, Putative heat shock protein HSP 90-beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB3PQ58FF7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HSP90AB3PQ58FF7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HSP90AB3PQ58FF7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HSP90AB3PQ58FF7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HSP90AB3PQ58FF7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HSP90AB3PQ58FF7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HSP90AB3PQ58FF7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HSP90AB3PQ58FF7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HSP90AB3PQ58FF7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HSP90AB3PQ58FF7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HSP90AB3PQ58FF7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HSP90AB3PQ58FF7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HSP90AB3PQ58FF7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HSP90AB3PQ58FF7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HSP90AB3PQ58FF7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HSP90AB3PQ58FF7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HSP90AB3PQ58FF7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HSP90AB3PQ58FF7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HSP90AB3PQ58FF7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HSP90AB3PQ58FF7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HSP90AB3PQ58FF7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HSP90AB3PQ58FF7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HSP90AB3PQ58FF7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HSP90AB3PQ58FF7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HSP90AB3PQ58FF7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HSP90AB3PQ58FF7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HSP90AB3PQ58FF7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HSP90AB3PQ58FF7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HSP90AB3PQ58FF7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HSP90AB3PQ58FF7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HSP90AB3PQ58FF7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HSP90AB3PQ58FF7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HSP90AB3PQ58FF7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HSP90AB3PQ58FF7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HSP90AB3PQ58FF7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HSP90AB3PQ58FF7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HSP90AB3PQ58FF7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HSP90AB3PQ58FF7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HSP90AB3PQ58FF7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HSP90AB3PQ58FF7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HSP90AB3PQ58FF7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HSP90AB3PQ58FF7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HSP90AB3PQ58FF7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms