Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KLHL22Q53GT1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL22Q53GT1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms