Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACSM3Q53FZ2 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms