Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC38Q502W7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms