Protein–RNA interactions for Protein: Q49MI3

CERKL, Ceramide kinase-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKLQ49MI3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CERKLQ49MI3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CERKLQ49MI3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CERKLQ49MI3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CERKLQ49MI3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CERKLQ49MI3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CERKLQ49MI3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CERKLQ49MI3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CERKLQ49MI3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CERKLQ49MI3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CERKLQ49MI3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CERKLQ49MI3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CERKLQ49MI3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CERKLQ49MI3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CERKLQ49MI3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CERKLQ49MI3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CERKLQ49MI3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CERKLQ49MI3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CERKLQ49MI3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CERKLQ49MI3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CERKLQ49MI3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CERKLQ49MI3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CERKLQ49MI3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CERKLQ49MI3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CERKLQ49MI3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CERKLQ49MI3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CERKLQ49MI3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CERKLQ49MI3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CERKLQ49MI3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CERKLQ49MI3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CERKLQ49MI3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CERKLQ49MI3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CERKLQ49MI3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CERKLQ49MI3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CERKLQ49MI3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms