Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TWISTNBQ3B726 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TWISTNBQ3B726 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms