Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
UVSSAQ2YD98 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms