Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms