Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SKIDA1Q1XH10 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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