Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL24A1Q17RW2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL24A1Q17RW2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
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