Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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RTL8BQ17RB0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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