Protein–RNA interactions for Protein: Q16875

PFKFB3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB3Q16875 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PFKFB3Q16875 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PFKFB3Q16875 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms