Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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NRF1Q16656 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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NRF1Q16656 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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NRF1Q16656 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRF1Q16656 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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NRF1Q16656 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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NRF1Q16656 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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NRF1Q16656 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
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NRF1Q16656 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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