Protein–RNA interactions for Protein: Q16553

LY6E, Lymphocyte antigen 6E, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY6EQ16553 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LY6EQ16553 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms