Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZIC1Q15915 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIC1Q15915 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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