Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms