Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYCP1Q15431 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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