Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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