Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDGFRLQ15198 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
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