Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SHPRHQ149N8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHPRHQ149N8 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
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