Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
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GPNMBQ14956 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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GPNMBQ14956 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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GPNMBQ14956 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
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GPNMBQ14956 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
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GPNMBQ14956 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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GPNMBQ14956 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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GPNMBQ14956 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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GPNMBQ14956 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
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