Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2H3Q13889 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms