Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DDX39BQ13838 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
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