Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SPTAN1Q13813 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SPTAN1Q13813 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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