Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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