Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
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DNASE1L3Q13609 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
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DNASE1L3Q13609 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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DNASE1L3Q13609 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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DNASE1L3Q13609 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DNASE1L3Q13609 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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