Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
PKD2Q13563 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
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