Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TCOF1Q13428 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TCOF1Q13428 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
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