Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
CPSF1Q10570 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CPSF1Q10570 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
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