Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms