Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LOXL1Q08397 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms