Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms