Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms