Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNDQ07001 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNDQ07001 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNDQ07001 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNDQ07001 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNDQ07001 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNDQ07001 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNDQ07001 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNDQ07001 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNDQ07001 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNDQ07001 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNDQ07001 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNDQ07001 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNDQ07001 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNDQ07001 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNDQ07001 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNDQ07001 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNDQ07001 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNDQ07001 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNDQ07001 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNDQ07001 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNDQ07001 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNDQ07001 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNDQ07001 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNDQ07001 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNDQ07001 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNDQ07001 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNDQ07001 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNDQ07001 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNDQ07001 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNDQ07001 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNDQ07001 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNDQ07001 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNDQ07001 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNDQ07001 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms