Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms