Protein–RNA interactions for Protein: Q03591

CFHR1, Complement factor H-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR1Q03591 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CFHR1Q03591 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CFHR1Q03591 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFHR1Q03591 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFHR1Q03591 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFHR1Q03591 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFHR1Q03591 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFHR1Q03591 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFHR1Q03591 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFHR1Q03591 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFHR1Q03591 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFHR1Q03591 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFHR1Q03591 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFHR1Q03591 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFHR1Q03591 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFHR1Q03591 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFHR1Q03591 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CFHR1Q03591 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFHR1Q03591 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFHR1Q03591 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CFHR1Q03591 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CFHR1Q03591 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CFHR1Q03591 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFHR1Q03591 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms