Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPM4P67936 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPM4P67936 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TPM4P67936 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPM4P67936 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPM4P67936 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPM4P67936 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPM4P67936 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPM4P67936 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPM4P67936 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPM4P67936 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPM4P67936 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPM4P67936 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPM4P67936 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPM4P67936 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPM4P67936 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPM4P67936 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPM4P67936 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPM4P67936 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPM4P67936 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPM4P67936 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPM4P67936 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPM4P67936 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPM4P67936 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TPM4P67936 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPM4P67936 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPM4P67936 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPM4P67936 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPM4P67936 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPM4P67936 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPM4P67936 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPM4P67936 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPM4P67936 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TPM4P67936 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPM4P67936 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPM4P67936 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPM4P67936 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPM4P67936 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPM4P67936 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPM4P67936 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPM4P67936 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPM4P67936 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPM4P67936 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPM4P67936 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPM4P67936 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPM4P67936 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPM4P67936 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TPM4P67936 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPM4P67936 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPM4P67936 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPM4P67936 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPM4P67936 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPM4P67936 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM4P67936 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM4P67936 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM4P67936 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM4P67936 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM4P67936 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM4P67936 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM4P67936 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM4P67936 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM4P67936 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM4P67936 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM4P67936 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM4P67936 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM4P67936 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM4P67936 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM4P67936 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM4P67936 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM4P67936 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM4P67936 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM4P67936 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM4P67936 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM4P67936 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM4P67936 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM4P67936 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM4P67936 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM4P67936 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM4P67936 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM4P67936 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM4P67936 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM4P67936 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM4P67936 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM4P67936 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM4P67936 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM4P67936 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM4P67936 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM4P67936 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPM4P67936 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPM4P67936 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPM4P67936 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPM4P67936 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPM4P67936 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPM4P67936 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPM4P67936 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPM4P67936 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPM4P67936 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPM4P67936 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPM4P67936 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPM4P67936 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms