Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO4P61968 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO4P61968 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO4P61968 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO4P61968 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO4P61968 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO4P61968 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO4P61968 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO4P61968 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO4P61968 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO4P61968 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO4P61968 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO4P61968 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO4P61968 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO4P61968 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO4P61968 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO4P61968 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO4P61968 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO4P61968 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO4P61968 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO4P61968 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO4P61968 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO4P61968 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO4P61968 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO4P61968 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO4P61968 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO4P61968 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO4P61968 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO4P61968 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO4P61968 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO4P61968 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO4P61968 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMO4P61968 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO4P61968 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO4P61968 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO4P61968 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO4P61968 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO4P61968 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO4P61968 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO4P61968 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO4P61968 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO4P61968 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO4P61968 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO4P61968 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO4P61968 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO4P61968 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO4P61968 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO4P61968 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO4P61968 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO4P61968 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO4P61968 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO4P61968 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO4P61968 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO4P61968 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO4P61968 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO4P61968 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO4P61968 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO4P61968 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO4P61968 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO4P61968 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO4P61968 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO4P61968 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMO4P61968 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO4P61968 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO4P61968 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO4P61968 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO4P61968 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO4P61968 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO4P61968 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO4P61968 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO4P61968 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO4P61968 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO4P61968 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO4P61968 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO4P61968 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO4P61968 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO4P61968 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO4P61968 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO4P61968 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO4P61968 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO4P61968 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO4P61968 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO4P61968 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO4P61968 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO4P61968 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO4P61968 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO4P61968 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO4P61968 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO4P61968 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO4P61968 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO4P61968 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO4P61968 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO4P61968 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LMO4P61968 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO4P61968 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO4P61968 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO4P61968 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO4P61968 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO4P61968 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO4P61968 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms