Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ARF3P61204 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARF3P61204 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARF3P61204 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARF3P61204 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARF3P61204 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARF3P61204 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARF3P61204 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARF3P61204 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARF3P61204 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARF3P61204 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARF3P61204 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARF3P61204 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARF3P61204 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARF3P61204 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARF3P61204 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARF3P61204 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARF3P61204 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARF3P61204 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARF3P61204 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARF3P61204 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARF3P61204 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARF3P61204 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARF3P61204 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARF3P61204 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARF3P61204 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ARF3P61204 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARF3P61204 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARF3P61204 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARF3P61204 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ARF3P61204 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARF3P61204 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARF3P61204 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARF3P61204 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARF3P61204 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARF3P61204 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARF3P61204 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ARF3P61204 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARF3P61204 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARF3P61204 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARF3P61204 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARF3P61204 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARF3P61204 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARF3P61204 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARF3P61204 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARF3P61204 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARF3P61204 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ARF3P61204 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARF3P61204 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARF3P61204 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARF3P61204 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARF3P61204 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARF3P61204 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARF3P61204 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARF3P61204 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARF3P61204 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARF3P61204 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARF3P61204 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARF3P61204 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARF3P61204 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARF3P61204 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARF3P61204 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARF3P61204 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARF3P61204 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARF3P61204 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARF3P61204 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARF3P61204 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARF3P61204 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARF3P61204 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARF3P61204 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARF3P61204 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARF3P61204 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARF3P61204 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARF3P61204 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARF3P61204 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARF3P61204 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARF3P61204 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ARF3P61204 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARF3P61204 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARF3P61204 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARF3P61204 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARF3P61204 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARF3P61204 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARF3P61204 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARF3P61204 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARF3P61204 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARF3P61204 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARF3P61204 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARF3P61204 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARF3P61204 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARF3P61204 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARF3P61204 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARF3P61204 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARF3P61204 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARF3P61204 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ARF3P61204 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ARF3P61204 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARF3P61204 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARF3P61204 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARF3P61204 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms