Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRE11P49959 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRE11P49959 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRE11P49959 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRE11P49959 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRE11P49959 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRE11P49959 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRE11P49959 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRE11P49959 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRE11P49959 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRE11P49959 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRE11P49959 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRE11P49959 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRE11P49959 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRE11P49959 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRE11P49959 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRE11P49959 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRE11P49959 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MRE11P49959 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRE11P49959 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRE11P49959 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRE11P49959 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRE11P49959 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRE11P49959 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRE11P49959 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRE11P49959 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRE11P49959 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRE11P49959 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRE11P49959 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRE11P49959 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRE11P49959 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MRE11P49959 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRE11P49959 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRE11P49959 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRE11P49959 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRE11P49959 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRE11P49959 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRE11P49959 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRE11P49959 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRE11P49959 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRE11P49959 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRE11P49959 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRE11P49959 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRE11P49959 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRE11P49959 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRE11P49959 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRE11P49959 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRE11P49959 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRE11P49959 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRE11P49959 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRE11P49959 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MRE11P49959 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MRE11P49959 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MRE11P49959 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MRE11P49959 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MRE11P49959 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRE11P49959 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRE11P49959 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRE11P49959 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRE11P49959 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRE11P49959 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MRE11P49959 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRE11P49959 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRE11P49959 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MRE11P49959 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRE11P49959 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRE11P49959 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MRE11P49959 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRE11P49959 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRE11P49959 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRE11P49959 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRE11P49959 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRE11P49959 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRE11P49959 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRE11P49959 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRE11P49959 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRE11P49959 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRE11P49959 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRE11P49959 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRE11P49959 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRE11P49959 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRE11P49959 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRE11P49959 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRE11P49959 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRE11P49959 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRE11P49959 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRE11P49959 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRE11P49959 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MRE11P49959 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRE11P49959 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRE11P49959 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRE11P49959 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MRE11P49959 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRE11P49959 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRE11P49959 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRE11P49959 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRE11P49959 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRE11P49959 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRE11P49959 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRE11P49959 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms