Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUP153P49790 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUP153P49790 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUP153P49790 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUP153P49790 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUP153P49790 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUP153P49790 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
NUP153P49790 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
NUP153P49790 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUP153P49790 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUP153P49790 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NUP153P49790 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NUP153P49790 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NUP153P49790 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NUP153P49790 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
NUP153P49790 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NUP153P49790 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NUP153P49790 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NUP153P49790 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NUP153P49790 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NUP153P49790 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NUP153P49790 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NUP153P49790 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NUP153P49790 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NUP153P49790 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NUP153P49790 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NUP153P49790 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
NUP153P49790 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
NUP153P49790 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
NUP153P49790 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
NUP153P49790 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
NUP153P49790 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
NUP153P49790 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
NUP153P49790 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
NUP153P49790 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
NUP153P49790 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NUP153P49790 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NUP153P49790 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NUP153P49790 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NUP153P49790 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
NUP153P49790 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NUP153P49790 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NUP153P49790 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NUP153P49790 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
NUP153P49790 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NUP153P49790 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
NUP153P49790 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NUP153P49790 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NUP153P49790 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
NUP153P49790 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NUP153P49790 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NUP153P49790 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NUP153P49790 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NUP153P49790 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
NUP153P49790 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NUP153P49790 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NUP153P49790 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
NUP153P49790 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NUP153P49790 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NUP153P49790 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NUP153P49790 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NUP153P49790 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NUP153P49790 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NUP153P49790 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NUP153P49790 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NUP153P49790 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NUP153P49790 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NUP153P49790 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NUP153P49790 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
NUP153P49790 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
NUP153P49790 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NUP153P49790 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NUP153P49790 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NUP153P49790 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NUP153P49790 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NUP153P49790 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NUP153P49790 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NUP153P49790 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NUP153P49790 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NUP153P49790 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NUP153P49790 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NUP153P49790 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NUP153P49790 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NUP153P49790 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NUP153P49790 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NUP153P49790 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NUP153P49790 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NUP153P49790 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NUP153P49790 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NUP153P49790 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NUP153P49790 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NUP153P49790 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NUP153P49790 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NUP153P49790 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NUP153P49790 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NUP153P49790 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NUP153P49790 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NUP153P49790 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NUP153P49790 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NUP153P49790 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms