Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VEGFBP49765 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms