Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM5AP29375 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms