Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PLNP26678 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PLNP26678 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PLNP26678 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PLNP26678 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PLNP26678 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PLNP26678 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PLNP26678 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PLNP26678 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PLNP26678 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PLNP26678 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PLNP26678 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PLNP26678 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PLNP26678 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PLNP26678 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PLNP26678 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PLNP26678 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PLNP26678 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PLNP26678 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PLNP26678 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PLNP26678 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PLNP26678 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PLNP26678 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PLNP26678 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PLNP26678 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PLNP26678 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PLNP26678 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PLNP26678 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PLNP26678 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PLNP26678 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PLNP26678 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PLNP26678 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PLNP26678 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PLNP26678 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PLNP26678 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PLNP26678 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PLNP26678 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PLNP26678 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PLNP26678 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PLNP26678 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PLNP26678 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PLNP26678 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PLNP26678 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PLNP26678 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PLNP26678 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PLNP26678 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PLNP26678 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PLNP26678 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PLNP26678 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PLNP26678 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PLNP26678 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PLNP26678 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PLNP26678 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PLNP26678 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PLNP26678 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PLNP26678 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PLNP26678 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PLNP26678 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PLNP26678 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PLNP26678 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PLNP26678 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PLNP26678 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PLNP26678 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PLNP26678 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PLNP26678 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PLNP26678 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PLNP26678 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PLNP26678 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PLNP26678 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PLNP26678 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PLNP26678 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PLNP26678 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PLNP26678 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PLNP26678 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PLNP26678 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PLNP26678 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PLNP26678 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PLNP26678 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PLNP26678 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PLNP26678 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PLNP26678 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PLNP26678 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
PLNP26678 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PLNP26678 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PLNP26678 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PLNP26678 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PLNP26678 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PLNP26678 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PLNP26678 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PLNP26678 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PLNP26678 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PLNP26678 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PLNP26678 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PLNP26678 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PLNP26678 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PLNP26678 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PLNP26678 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PLNP26678 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PLNP26678 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PLNP26678 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms