Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
POLR2AP24928 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2AP24928 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms