Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRAP18433 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
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