Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DESP17661 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DESP17661 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DESP17661 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DESP17661 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DESP17661 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DESP17661 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DESP17661 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DESP17661 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DESP17661 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DESP17661 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DESP17661 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
DESP17661 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DESP17661 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DESP17661 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DESP17661 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
DESP17661 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DESP17661 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DESP17661 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DESP17661 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DESP17661 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DESP17661 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DESP17661 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DESP17661 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DESP17661 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DESP17661 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DESP17661 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
DESP17661 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DESP17661 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DESP17661 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DESP17661 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DESP17661 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DESP17661 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DESP17661 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DESP17661 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DESP17661 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DESP17661 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DESP17661 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DESP17661 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DESP17661 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DESP17661 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DESP17661 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DESP17661 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DESP17661 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DESP17661 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DESP17661 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DESP17661 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DESP17661 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DESP17661 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DESP17661 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DESP17661 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DESP17661 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DESP17661 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DESP17661 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DESP17661 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DESP17661 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DESP17661 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DESP17661 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DESP17661 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DESP17661 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DESP17661 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DESP17661 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DESP17661 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DESP17661 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DESP17661 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DESP17661 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DESP17661 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DESP17661 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DESP17661 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DESP17661 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DESP17661 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DESP17661 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DESP17661 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DESP17661 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DESP17661 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DESP17661 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DESP17661 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DESP17661 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DESP17661 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DESP17661 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DESP17661 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DESP17661 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DESP17661 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DESP17661 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DESP17661 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DESP17661 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DESP17661 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DESP17661 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DESP17661 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DESP17661 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DESP17661 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DESP17661 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DESP17661 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DESP17661 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DESP17661 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DESP17661 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DESP17661 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DESP17661 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DESP17661 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DESP17661 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms